Initiation à la virologie

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Titre : concentration d’anticorps, établie par un test de dilution sérielle du sérum.

Traceur ou marqueur radioactif : isotope radioactif dont la présence est décelable par le rayonnement qu’il émet.

Transcriptase inverse (reverse transcriptase/RT) : ou "reverse transcriptase" : polymérase capable de synthétiser un ADN complémentaire à une matrice d'ARN (ADN-polymérase ARN-dépendante). Elle possède également une activité ADN-polymérase ADN-dépendante. La transcriptase inverse est utilisée par les rétrovirus, mais aussi par le virus de l'hépatite B, le virus de la mosaïque du chou-fleur, et par de nombreux éléments transposables des cellules de mammifères.

Transduction : transfert de gènes entre bactéries par le biais de bactériophages. On distingue deux types de voie de transduction :

  • transduction généralisée : Au cours du cycle lytique de phages virulents ou tempérés, il se peut que de l’ADN bactérien soit encapsidé avec peu ou sans ADN viral. La particule virale résultante va injecter cet ADN dans une nouvelle bactérie sans initier de cycle lytique. L’ADN ainsi transféré peut alors recombiner avec le génome de l’hôte ou être exprimé jusqu’à la division cellulaire suivante sans intégrer le génome.
  • transduction spécifique : Ce cas de figure se présente lorsqu’un prophage intégré dans le chromosome est induit et s’excise du chromosome en emportant de l’ADN de l’hôte, contigu au site d’intégration. Après infection d’une nouvelle bactérie, le génome du phage est habituellement défectif, mais le transfert de gènes est possible par recombinaison avec le chromosome.

Il faut préciser ici que même s’il ne figure pas en tant que tel dans la définition de la transduction, l’infection d’une cellule par un bactériophage, surtout si ce dernier est tempéré, est en soi un mouvement horizontal. Le nouveau phage peut en effet apporter des gènes à la bactérie et modifier le patrimoine génétique de la cellule par l’apport de ces gènes.

Transfert horizontal de matériel génétique : contrairement au transfert vertical, où les deux cellules filles héritent chacune d’une copie du patrimoine génétique de la cellule mère, le transfert horizontal chez les bactéries désigne le mouvement d’ADN d’une cellule à l’autre par voie de transformation, transduction ou conjugaison.

Transformation : mode de transmission de gènes chez les bactéries par lequel de l’ADN libre est importé dans la cellule et intégré au génome de la receveuse.

Transformation cellulaire : modification progressive d'une cellule menant à son immortalisation et à son caractère tumorigène.
La transformation peut impliquer:

  • l'augmentation de la capacité d'une cellule à proliférer;
  • la perte de l'inhibition de croissance liée au contact d'autres cellules ("inhibition de contact").
  • la capacité de former des colonies dans un milieu gélifié par l'agar.
  • la diminution de la dépendance vis à vis des facteurs de croissance, pour la prolifération.
  • des modifications importantes du cytosquelette de la cellule.

Transposition : mouvement d’ADN (comportant un ou plusieurs gènes) d’un endroit du génome vers un autre site, aléatoire ou spécifique, à l’intérieur d’une même cellule. Les éléments transposables peuvent tomber dans deux catégories: les transposons à ADN (classe II) et les rétrotransposons (classe I). La transpositon de classe II peut être réplicative, et dans ce cas des copies du transposon sont générées et insérées à différents endroits du génome, ou bien non-réplicative, et alors le transposon est coupé de son site avant d’être inséré à un autre endroit du génome. Les rétrotransposons quant à eux fonctionnent comme les transposons réplicatifs, mais passent en plus par une étape de transcription en ARN avant d’être copiés en ADN, tout comme les rétrovirus tels que le virus du SIDA.

Unités : concentration d’anticorps, établie en comparant la valeur d’un test de détection à une courbe standard.

Vésicules à clathrine (coated pits) : type de vésicules d'endocytose.