Initiation à la virologie
Nommez un virus de plantes qui a été un modèle dans les études fondamentales en virologie.
Le virus de la mosaïque du tabac (TMV/VMT)
Donnez deux noms de scientifiques (nom de famille) liés à la découverte de la transcriptase inverse ou « reverse transcriptase ».
H. Temin et D. Baltimore
Décrivez brièvement les expériences qui menèrent à la découverte des premiers virus.
La première expérience indiquant l'implication d'un agent ultrafiltrable, plus petit que les bactéries, fut la transmission de la mosaïque du tabac par Dmitrii Ivanovski (1864-1920) à partir de filtrats de plantes en 1892. Cependant Ivanovski maintiendra l’explication bactérienne, sous forme de spores ou de toxines. Ce n'est que 6 ans plus tard que Martinus Beijerinck (1851-1931) comprendra les conséquences de cette observation en la répétant.
Que signifie le terme « ADN proviral » ? Expliquez en une phrase.
Les rétrovirus qui sont des virus ARN seront rétrotranscrits en ADN dans la cellule hôte et c’est de cet « ADN proviral » que seront formés les nouveaux brins génomiques d’ARN
Enumérez six caractères généraux de virus (au moins 4).
- les virus sont très petits (ultrafiltrables)
- les virus se répliquent
- les virus ont un seul type d’acide nucléique
- les virus sont des éléments réplicatifs assemblés à partir de leurs composants
- les virus sont strictement dépendants du métabolisme d’une cellule
- Les virus sont spécifiques de cellule et d’organe
Citez les différentes formes d’acide nucléique déjà répertoriées comme constituant du génome viral
Un virus est constitué d’un génome composé d’un ou plusieurs brins d’acide désoxyribonucléique ou ribonucléique, sous forme linéaire ou circulaire. On distingue des ARN et ADN simple brin ou double brin, des ARN de polarité positive ou négative ou encore ambisens.
Quelle est la différence entre une capside de symétrie hélicoïdale et une capside de symétrie icosaédrique ?
Une capside de symétrie hélicoïdale est formée de l’assemblage en hélice de protéines de capside, alors qu’une capside de symétrie icosaédrique est une capside qui prend la forme d’un polyèdre régulier formé de 20 faces triangulaires, proche d’une sphère. Une capside de symétrie icosaédrique est par nature limitée dans sa contenance interne, tandis qu’une particule virale de symétrie hélicoïdale peut adopter une longueur variable.
Donnez les trois critères majeurs de classification des virus.
- Le type de génome viral et son organisation
- La stratégie de réplication virale
- La structure de la particule virale
Citez 3 critères définissant une espèce virale.
La séquence génomique, le spectre d’hôte et la pathogénicité
Que signifie qu’un ARN viral est de polarité négative ? Expliquez en une phrase.
Les virus à ARN négatif ont un génome dont la polarité est complémentaire à celle des ARNs messagers
Que signifie qu ’un ARN viral est de polarité positive ? Expliquez en une phrase.
Un ARN viral est de polarité positive quand cet ARN a la même polarité que l'ARN messager.
Que signifie qu’un ARN viral est ambisens ? Expliquez en une phrase.
Un ARN est dit ambisens quand tant le brin original que le brin complémentaire ont la même polarité que celle d'au moins un ARN messager.
Pourquoi les virus à ARN ont-ils généralement un cycle cytoplasmique ? Expliquez en maximum deux phrases.
Aucune ARN-polymérase ARN-dépendante capable de retranscrire de longs segments d'ARN n'a été décelée dans les cellules de mammifères et a fortiori dans leur noyau. En se répliquant dans le cytoplasme des cellules, les virus ARN peuvent exploiter la présence des ribosomes cellulaires pour assurer la traduction de leurs ARNm.
Que signifie « transcriptase inverse » ? Expliquez en une phrase et donnez un exemple de virus possédant une transcriptase inverse.
La transcriptase inverse (reverse transcriptase/RT) est une enzyme qui convertit un ARN+ viral en ADN double brin (rétrotranscription). Des exemples sont les rétrovirus, les hepadnavirus et les caulimovirus.
Expliquez le terme « décapsidation » en maximum deux phrases.
Au cours de la pénétration du génome viral dans la cellule, celui-ci est partiellement ou totalement débarrassé des protéines qui le protégeaient dans le virion: ce processus de déshabillage est appelé "décapsidation"
Citez les trois grands mécanismes qui permettent des variations génétiques chez les virus.
- La mutation
- La recombinaison
- Le réassortiment
Expliquez brièvement ce qu’est une pandémie
Une pandémie est une épidémie qui se développe de manière généralisée, au niveau mondial. Cette épidémie est caractérisée par une expansion rapide à la population non immune au virus. Le virus de la grippe est un exemple de virus capable de provoquer de telles pandémies.
Parmi les termes suivants, quel est l’intrus ? Les virus peuvent évoluer suite à des :
> Classez les termes suivants dans l’ordre chronologique d’un cycle viral type.
Vous avez droit à 3 essais.
> Sur ce schéma (de Ellis et Delbrück pour le bactériophage lambda), indiquez la légende des zones 1, 2, 3 et des courbes A et B.
Vous avez droit à 3 essais.
> Qui suis-je ?
Donnez le nom qui correspond à la définition. A chaque définition le nombre de points attribués diminue.
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Une bonne réponse après la dernière définition = 1 point.
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